Sohn des Grafen Gaston von Foix, Erb-Prinz von Navarra und der Margarete von Frankreich, Tochter von König Karl VII.
 

Franz Phoebus folgte 1472 seinem Großvater als Graf von Foix und Bigorre, Vicomte von Bearn und Castelbon und 1479 seiner Großmutter Eleonore als König von Navarra und wurde in einer Zeit großer Unruhen nicht überall in Navarra anerkannt, da Ferdinand II. von Aragon intriegenreich im Hintergrund arbeitete. Er wurde vergiftet.